Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm3278L7N2D2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Gm3278L7N2D2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm3278L7N2D2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3278L7N2D2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm3278L7N2D2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3278L7N2D2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3278L7N2D2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3278L7N2D2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3278L7N2D2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3278L7N2D2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3278L7N2D2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3278L7N2D2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3278L7N2D2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm3278L7N2D2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm3278L7N2D2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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