Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm20878L7N244 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gm20878L7N244 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20878L7N244 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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