Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vmn2r88L7N1W8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn2r88L7N1W8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn2r88L7N1W8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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