Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm21972J3QN38 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm21972J3QN38 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21972J3QN38 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.3 ms