Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hmgxb3G3X9M3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hmgxb3G3X9M3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmgxb3G3X9M3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms