Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna9G3X8Z7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Chrna9G3X8Z7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chrna9G3X8Z7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms