Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ScaperF8VQ70 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ScaperF8VQ70 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ScaperF8VQ70 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ScaperF8VQ70 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms