Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LctF8VPT3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LctF8VPT3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LctF8VPT3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms