Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Crocc2F6XLV1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Crocc2F6XLV1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Crocc2F6XLV1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Crocc2F6XLV1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms