Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm29094F6Q785 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm29094F6Q785 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm29094F6Q785 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm29094F6Q785 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms