Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
R3hdm1E9Q9Q2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
R3hdm1E9Q9Q2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
R3hdm1E9Q9Q2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.9 ms