Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Col22a1E9Q7P1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Col22a1E9Q7P1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col22a1E9Q7P1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col22a1E9Q7P1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms