Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Urb2E9Q7L1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Urb2E9Q7L1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Urb2E9Q7L1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Urb2E9Q7L1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Urb2E9Q7L1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms