Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Simc1E9Q6E9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Simc1E9Q6E9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Simc1E9Q6E9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Simc1E9Q6E9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms