Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Srsf11E9Q6E5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Srsf11E9Q6E5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms