Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trip11E9Q512 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trip11E9Q512 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms