Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde8bE9Q4S1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde8bE9Q4S1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pde8bE9Q4S1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pde8bE9Q4S1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pde8bE9Q4S1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pde8bE9Q4S1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde8bE9Q4S1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde8bE9Q4S1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde8bE9Q4S1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde8bE9Q4S1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde8bE9Q4S1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pde8bE9Q4S1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pde8bE9Q4S1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.6 ms