Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4E0

5031410I06Rik, RIKEN cDNA 5031410I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5031410I06RikE9Q4E0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
5031410I06RikE9Q4E0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
5031410I06RikE9Q4E0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
5031410I06RikE9Q4E0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
5031410I06RikE9Q4E0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
5031410I06RikE9Q4E0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
5031410I06RikE9Q4E0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
5031410I06RikE9Q4E0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
5031410I06RikE9Q4E0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
5031410I06RikE9Q4E0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
5031410I06RikE9Q4E0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms