Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Fndc1E9Q043 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Fndc1E9Q043 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Fndc1E9Q043 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Fndc1E9Q043 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms