Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Scaf11E9PZM7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Scaf11E9PZM7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Scaf11E9PZM7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Scaf11E9PZM7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Scaf11E9PZM7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms