Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Piezo1E2JF22 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Piezo1E2JF22 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms