Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tmem200bD3Z0P8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmem200bD3Z0P8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem200bD3Z0P8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms