Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf217D3YYI7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rnf217D3YYI7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Rnf217D3YYI7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf217D3YYI7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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