Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
Cttnbp2B9EJA2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cttnbp2B9EJA2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Cttnbp2B9EJA2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Cttnbp2B9EJA2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Cttnbp2B9EJA2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms