Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia4B8QI36 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia4B8QI36 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ppfia4B8QI36 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ppfia4B8QI36 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppfia4B8QI36 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppfia4B8QI36 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms