Protein–RNA interactions for Protein: B7XG49

Fam71a, Family with sequence similarity 71, member A, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71aB7XG49 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71aB7XG49 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam71aB7XG49 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam71aB7XG49 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71aB7XG49 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71aB7XG49 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71aB7XG49 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71aB7XG49 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71aB7XG49 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71aB7XG49 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71aB7XG49 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71aB7XG49 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71aB7XG49 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms