Protein–RNA interactions for Protein: B5X0E4

Abcb5, ATP-binding cassette sub-family B member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb5B5X0E4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Abcb5B5X0E4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcb5B5X0E4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcb5B5X0E4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms