Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cfap58B2RW38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cfap58B2RW38 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfap58B2RW38 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms