Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clrn2B2RVW2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clrn2B2RVW2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Clrn2B2RVW2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms