Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Uhrf1bp1B2KF50 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms