Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprsB0V2N1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
PtprsB0V2N1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprsB0V2N1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms