Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trmt1lA2RSY6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trmt1lA2RSY6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trmt1lA2RSY6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt1lA2RSY6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt1lA2RSY6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trmt1lA2RSY6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms