Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Upf2A2AT37 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Upf2A2AT37 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Upf2A2AT37 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Upf2A2AT37 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms