Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn3aA2ASI5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Scn3aA2ASI5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn3aA2ASI5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms