Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb1A2AQ07 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tubb1A2AQ07 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubb1A2AQ07 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms