Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Frmpd1A2AKB4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Frmpd1A2AKB4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Frmpd1A2AKB4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Frmpd1A2AKB4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Frmpd1A2AKB4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms