Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Itgb4A2A863 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Itgb4A2A863 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Itgb4A2A863 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms