Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP35

Gm28919, Predicted gene 28919, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28919A0A087WP35 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28919A0A087WP35 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28919A0A087WP35 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28919A0A087WP35 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms