Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Lrit3W8DXL4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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