Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Speer3W4VSP1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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