Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Gm17190V9GX38 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm17190V9GX38 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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Gm17190V9GX38 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm17190V9GX38 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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