Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Crlf3Q9Z2L7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Crlf3Q9Z2L7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms