Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms