Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Syngr4Q9Z1L2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms