Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nek4Q9Z1J2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms