Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Skp2Q9Z0Z3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms