Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Pfdn5Q9WU28 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Pfdn5Q9WU28 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Pfdn5Q9WU28 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Pfdn5Q9WU28 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms