Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trpc2Q9R244 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trpc2Q9R244 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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