Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Psmb3Q9R1P1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Psmb3Q9R1P1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms