Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gpc1Q9QZF2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gpc1Q9QZF2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gpc1Q9QZF2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gpc1Q9QZF2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gpc1Q9QZF2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Gpc1Q9QZF2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gpc1Q9QZF2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms